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Message par Azanii le Lun 9 Avr - 14:55

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Biologie 120px-49

Nos échantillons ont pris de la hauteur !


Yves-Marie de Barnenez a écrit:
DÉBUT DU PROGRAMME OCEAN-ESPACE



Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE) a commencé sa mission de recherche en microbiologie dans le nouveau module "Saint-Ange". Le très imposant compartiment pressurisé qu'il possède a été rempli d'échantillons prélevés par Le Décan lors de sa dernière plongée à 5 000 mètres. Le but de cette première expérience et d'observer comment réagissent ces organismes prélevés par l'Organisation Micromondiale d'Océanographie en apesanteur.

Pour l'instant ils sont conservés à une pression et une température proche de leur zone de prélèvement dans le container pressurisé. Une somme importante d'échantillons de sédiments, nématodes, foraminifères, pennatules, éponges, oursins et euryalina sont conservé dans de petit compartiments à l'intérieur. Il est possible de les extraire un à un sans faire chuter la pression interne du container principal. Joseph Dolariant est bien évidemment équipé pour ne pas contaminer les échantillons.


Biologie Labora10
Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant extrait un compartiment

Le premier compartiment extrait contient des sédiments riches en bactéries et protozoaires. Joseph Dolariant va faire doucement descendre la pression et augmenter la température de l'échantillon tout en faisant augmenter le taux d'oxygène en le mettant en contact avec de l'eau de mer dans une flasque. Il pourra ensuite faire une observation préliminaire au microscope avant d'analyser une partie de l'échantillon dans un cytomètre de flux avec des marqueurs de viabilité. Il pourra ainsi déterminer si ces organisme survivent en apesanteur, si ils ne sont que légèrement détériorés,si ils meurent, si ils se multiplient ou si ils se comportent comme dans leur milieux d'origine.

Yves-Marie de Barnenez
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Message par Azanii le Mer 11 Avr - 17:33

Biologie Univer16

Biologie 120px-51


Yves-Marie de Barnenez a écrit:
PROGRAMME OCEAN-ESPACE


Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE) a commencé par identifier deux populations majoritaires de bactéries dans l'échantillon 1 par des méthodes de microbiologie classiques (Étalement sur boite, repiquage ...) Ces deux populations ont été arbitrairement nommées population A et population B.
La première déduction de cet examen préanalytique est que ces deux populations de bactéries provenant d'une profondeur de 5000 mètres survivent et se multiplient en apesanteur et dans des conditions atmosphériques "respirables" ce qui est en soit un bon début pour le Programme OCEAN-SPACE.

Nous avons donc du matériels biologique sur lequel travailler.


Biologie 290px-10
Population A au microscope (gram-)


Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant a ensuite cherché à déterminer quel était le "stress" de ces populations bactériennes en apesanteur. Il a donc préparé une suspension de chaque population et les a analysées au cytomètre de flux après les avoir marquées avec des fluorochromes déterminant la viabilité de la population.


Biologie Sans_t11
Résultat de l'analyse par le cytomètre de flux

On peut observer que la population A est composée de bacilles de plus grande taille que la population B ce qui confirme l'examen microscopique. Ce qui est intéressant c'est que la population B a plus souffert des conditions atmosphériques et d'apesanteur que la population A. On voit clairement une population fluorescent en rouge (cellules morte) plus importantes et des débris de bactéries en dessous de la population principale (en bas du graphique).

La question est, d’où vient cette différence ? La simple taille, c'est peu probable. Des particularités de la paroi bactérienne ? Joseph Dolariant a décidé d'explorer cette piste.


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Message par Azanii le Lun 14 Mai - 5:26

Yves-Marie de Barnenez a écrit:Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE) a avancé dans ses travaux de microbiologie. Il a identifié un plasmide dans la population bactérienne A qui pourrait bien être à l'origine de la meilleure résistance de cette population aux conditions en apesanteur.

Par des méthodes de génie biologique il a réussi à isoler ce plasmide (A) et par électroporation il l'a intégré dans une solution de population bactérienne B.



Biologie Ylectr10


Ainsi il a obtenu une population de bactérie B contenant des plasmides de la population A :


Biologie Image010

Joseph Dolariant a remis cette population de bactérie B modifiée en culture dans des flasques. Nous saurons bientôt si cette modification a un effet sur la résistance en apesanteur des bactéries B ou si il s'agit d'une mauvaise piste. En cas de succès le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant pourrait bien avoir identifié un plasmide favorisant la survie de bactéries en apesanteur, ce qui serait très étonnant pour des bactéries provenant des profondeurs de l'Archipel. Un argument qui pourrait étayer l'hypothèse extramicromondiale de la vie...


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Message par Azanii le Lun 14 Mai - 5:27

Yves-Marie de Barnenez a écrit:Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant a pu observer une croissance spectaculaire des bactérie de la population B modifiée dans la flasque. A l'observation c'était flagrant. Pour se faire une idée de la vitesse de croissance, il a inoculer des bactéries de la population B dans une boite P. sur un milieux très pauvre en nutriments.



Biologie Croiss10


La vitesse de croissance est spectaculaire par rapport à une bactérie banale au sol. Certaines bactéries poussent plus vite que d'autres. L'hypothèse est qu'elles ont intégrées plus de plasmides de la population A. Pour avoir une comparaison avec le premier test de viabilité, Joseph Dolariant a passé au cytomètre de flux la population A et la population B modifiée dans les mêmes conditions. Rappelons que les marqueurs de viabilité fluorescent en vert quand les bactéries sont vivantes et en rouge quand elles sont mortes.



Biologie Sans_t12
19/04/2018




Biologie Sans_t11
11/04/2018


Le résultat est flagrant. Cette bactérie B modifiée provenant des abysses de l'Archipel a développé une capacité de croissance en apesanteur spectaculaire. Il n'y a presque plus de bactéries mortes (rouges) de la population B modifiée et celles qui sont vivantes ont considérablement augmenté (vert). Cela ne peu pas être due simplement au plasmide provenant de la population A, il a très certainement intégré le génome lui même et probablement activé des gènes "endormis". Des gènes qui auraient pu servir à survivre dans un astéroïde ou une comète percutant le Micromonde et y apporter la vie...Des perspectives de recherche passionnantes...



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Message par Azanii le Lun 14 Mai - 5:27

Pendant ces quelques jours le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant a remis en culture la population de bactéries A et B dans leur section du caisson hyperbare. Il a augmenté progressivement la pression pour les remettre dans leurs conditions originelles à 5000 mètres de profondeur. Puis a procédé comme à la première ouverture pour analyser par cytométrie de flux leur viabilité.



Biologie Viabil10
24/09/1927


La culture de bactéries A qui sert ici de population témoin a bien réagit à la décompression comme à la première expérience. Par contre la population B est quasiment totalement morte (marquée en rouge). Ceci étaye l'hypothèse que le plasmide a modifié le génome de la bactérie en s'y intégrant. Si le plasmide était resté en dehors du génome, les gènes propres au génome des bactéries de la population B auraient pris le relais et assuré la survie de ces bactéries.

Au contraire la population B a été incapable de s'adapter, son génome a donc été modifié par le plasmide activant des gènes "endormis" lui permettant de proliférer en apesanteur. Capacité qui pourrait permettre à des bactéries de survivre dans des comètes ou des astéroïdes et donc d'avoir apporté la vie sur le Micromonde.

L’existence de ces gènes est donc prouvée, reste à identifier quelles portions de l'ADN des bactéries B ont été activées. Bactérie B modifiées que le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant a baptisé, non sans un certain narcissisme, "Dolariannes".


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Message par Noba le Dim 17 Juin - 23:47

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Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant a commencé à étudier un nouvel échantillon issu de nos prélèvements.
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Message par Noba le Dim 17 Juin - 23:52

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Yves-Marie de Barnenez a écrit:
PROGRAMME OCEAN-ESPACE



Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE) continue sa mission de recherche en microbiologie dans le module "Saint-Ange". Le très imposant compartiment pressurisé qu'il possède a été rempli d'échantillons prélevés par Le Décan lors d'une plongée à 5 000 mètres. Le but de ces  et d'observer comment réagissent les organismes prélevés par l'Organisation Micromondiale d'Océanographie en apesanteur.

Pour l'instant ils sont conservés à une pression et une température proche de leur zone de prélèvement dans le container pressurisé. Une somme importante d'échantillons de sédiments, nématodes, foraminifères, pennatules, éponges, oursins et euryalina sont conservé dans de petit compartiments interne. Il est possible de les extraire un à un sans faire chuter la pression interne du container principal. Joseph Dolariant est bien évidemment équipé pour ne pas contaminer les échantillons.


Biologie Labora10
Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant extrait un compartiment

Le deuxième compartiment extrait contient des protozoaires, on passe donc de l'étude d'organismes procaryotes à des eucaryotes. Joseph Dolariant va faire doucement descendre la pression et augmenter la température de l'échantillon tout en le mettant en contact avec de l'eau de mer dans une flasque. Il pourra ensuite faire une observation préliminaire au microscope avant d'effectuer des analyses. Il pourra ainsi déterminer si ces organisme survivent en apesanteur, si ils ne sont que légèrement détériorés,si ils meurent, si ils se multiplient ou si ils se comportent comme dans leur milieux d'origine.


Parmi les dizaines d'espèces de protozoaires que contient l'échantillon, le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire a décidé de commencer par s'intéresser à une amibe en particulier. Celle-ci avait visiblement bien supporté la décompression, on pouvait observer ces pseudopodes bouger. Ce sera son sujet d'études pour probablement quelques semaines.

Biologie Chaos_10
L'amibe en question au microscope x400



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Message par Noba le Dim 17 Fév - 12:33

Depuis la SOE "Charles le Grand" :



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Le lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE) m'a laissé la suite de ses travaux de microbiologie dans le module "Saint-Ange". Ce petit module de la Station Orbitale "Charles le grand" est conçu pour ce genre de travaux. Pour des raisons de sécurité il est le seul dont l'accès soit réglementé. Il est constamment verrouillé et possède un sas de décontamination. Il contient un compartiment pressurisé rempli d'échantillons de l'Organisation Micromondiale Océanographique prélevés par Le Décan lors d'une plongée à 5 000 mètres. Le but des travaux entamés et d'observer comment réagissent les organismes prélevés dans les profondeurs de l'Archipel en apesanteur. Il est possible de les extraire un à un sans faire chuter la pression interne du container principal.


Biologie Labora10
Extraction d'un compartiment

Le lieutenant de Vaisseau Dolariant s'intéressait à une amibe en particulier. Celle-ci avait visiblement bien supporté la décompression, on pouvait observer ces pseudopodes bouger. Voici l'observation qu'il avait fait avant son départ de la station :

Biologie Chaos_10
L'amibe en question au microscope x400 par Joseph Dolariant

J'ai donc extrait le petit compartiment contenant la précieuse amibe. La bonne nouvelle c'est qu'à l'observation microscopique, elle est toujours vivante. Le problème qui se présente à moi est son aspect. Normalement, dans le milieu pauvre en nutriments dans lequel elle était conservée, j'aurais dût la trouver dans un état proche de l'observation de Joseph Dolariant (ci-dessus). Ce n'est pas le cas, à ma grande surprise elle a produit de nouveaux pseudopodes mais surtout elle semble avoir entamé une division. La reproduction asexuée est la principale forme de reproduction des organismes unicellulaires comme les amibes, il n'est donc pas surprenant qu'elle se divise toute seule sans "monsieur amibe". Ce n'est pas ce qui m'intrigue, voici les étapes d'une division "normale" :


Biologie Divisi10


Le soucis c'est que "l'Amibe Dolariant", appelons là ainsi pour l'instant, semble être en deuxième phase mais j'ai observé trois noyaux. Cas extrêmement atypique en l'état de nos connaissances et qui me pose plusieurs problèmes.

- Est-ce vraiment une division en cours ou autre-chose ?
- L'ADN de ces trois noyaux est-il identique, comme pour une division normale ?
- Quelle est la source de nutriments utilisée ?

Je vais remettre "l'Amibe Dolariant" dans des conditions de croissance optimales après avoir prélevé le milieu de conservation pour analyse et observer l'évolution de cette singularité en apesanteur.



Biologie Chaos_10
Mon observation au microscope x400 à la sortie du compartiment



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Message par Azanii le Sam 2 Mar - 17:26

Biologie 120px-19

Le programme OCEAN-SPACE, partenariat entre l'Organisation Micromondiale Océanographique et le Programme Spatial Edoranais, continue à bord de la Station Orbitale "Charles le Grand". Noba, microbiologiste à l'Université de Rakur, continue le travail du lieutenant de Vaisseau Joseph Dolariant de l'Office Scientifique de l'Armée du Saint-Empire (OSASE). Ces organisme provenant des profondeurs de la mer du Micromonde réagissent étonnamment en apesanteur.

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J'ai remis "l'Amibe Dolariant" dans des conditions de croissance optimales après avoir prélevé le milieu de conservation pour analyse et observer l'évolution de cette singularité en apesanteur. Voici le dernier cliché avant que je transfère "l'amibe" dans une flasque de culture.



Biologie Chaos_10
Mon observation au microscope x400 à la sortie du compartiment


Ayant analysé le milieu de conservation, il était presque dépourvu de nanoplancton. Il s'agit d'organismes dont la taille est comprise entre 2 µm et 20 µm. Il se compose de microorganismes unicellulaire présent en grandes profondeurs dans les océans du Micromonde. J'ai donc réintroduit une quantité importante de ces organismes facilement cultivable en apesanteur dans la flasque.
Rapidement, il est devenu évidant qu'il ne s’agissait en aucun cas d'une reproduction par division atypique. Cet organisme unicellulaire s'est progressivement développé par agrégat de cellules de plus en plus nombreuses.
Le nanoplancton est rapidement devenu insuffisant à sa croissance, j'ai introduit du phytoplancton plus commun, de plus grosse taille. L'organisme que je ne peux plus désigner comme une amibe mais comme un protozoaire a absorbé rapidement cette nouvelle source de nutriments.



Les cellules se sont évidements spécialisées, certaines formant des tentacules, d'autres des cellules digestives. Mais l'ADN de toutes ces cellules reste le même, j'ai pu le vérifier par des techniques de génie biologique de base. Il s'agit donc du même organisme ayant franchit la barrière unicellulaire en seulement une dizaine de jours en apesanteur, devant une entité multicellulaire complexe.

Je ne sais pas ou se stabilisera cette croissance, "l'Organisme Dolariant" est conservé en milieu clos par mesure de sécurité.


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Message par Azanii le Jeu 2 Mai - 18:01

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"l'Organisme Dolariant" s'est progressivement développé par agrégat de cellules de plus en plus nombreuses devenant un polype de type "hydre". Rappelons que "l'Amibe Dolariant" initial provenait des prélèvement effectués en mer par l'L'Organisation Micromondiale Océanographique à 5000 mètres de profondeur. Les hydres communs ne vivent qu'en eau douce dans l'état de nos connaissance, il est donc plus que surprenant que cette simple amibe unicellulaire est évoluée en apesanteur vers un polype comportant toutes les caractéristique morphologiques des hydres. Je lui apporte toujours des quantités régulière de phytoplancton.
Je ne savais pas ou se stabiliserait cette croissance, "l'Organisme Dolariant" était donc conservé en milieu clos par mesure de sécurité. Je l'ai à nouveau observé cette semaine et à ma grande surprise il semble avoir entamé une reproduction. Etant le seul spécimen dans son milieu, cette reproduction ne peut être que asexuée.

Chez les hydres d'eau douce une diverticule de la cavité digestive apparaît sur le corps de l'hydre. Cette excroissance grandit en formant une sorte de bourgeon. Celui-ci va s'ouvrir au bout en formant une "bouche" qui se garnira par la suite de tentacules. Finalement, ce bourgeon possède toutes les caractéristiques d'une hydre normale, et ainsi, le bourgeon va se séparer de l'hydre. Cette hydre est génétiquement identique à son parent. Mais il est aussi possible que les hydres restent solidaires et forment une petite "colonie" de deux à quatre hydres.

C'est ce que j'ai observé chez "l'Organisme Dolariant", un premier hydre identique semble prêt à se détacher mais reste solidaire alors qu'un troisième bourgeon apparait. J'ai attendu plusieurs jours, je ne sais pas encore si il va véritablement se diviser ou former une "colonie". Il est extrêmement troublant que cette organisme unicellulaire provenant des profondeurs des mers du Micromonde ait évolué en apesanteur vers un "animal" complexe ayant toutes les caractéristique d'un hydre d'eau douce et qu'il semble même se multiplier. J'avoue que cette observation remets en cause tout ce que l'on enseigne à l'Université de Rakur et m'occupe l'esprit au delà du raisonnable.

Voici une vidéo que j'ai filmé lors de mes observations au microscope polarisant, je ne voudrais pas passer pour une folle :





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